Σε μια μεγάλη κατσαρόλα βάζουμε το βούτυρο να λιώσει σε μέτρια φωτιά. Προσθέτουμε τα κρεμμύδια, το σκόρδο και το θυμάρι, και σοτάρουμε για περίπου 4 λεπτά ώσπου να μαλακώσουν τα κρεμμύδια.

Δυναμώνουμε τη φωτιά και προσθέτουμε τα μανιτάρια ανακατεύοντας συνεχώς για 3-4 λεπτά. Σκεπάζουμε τα μανιτάρια με ζωμό κότας και βράζουμε για 25 λεπτά σε πολύ χαμηλή φωτιά. Εάν θέλουμε η σούπα μας να γίνει πιο αραιή, προσθέτουμε λίγο νερό όσο βράζει. Αφαιρούμε το θυμάρι και το σκόρδο, αλατοπιπερώνουμε και χτυπάμε τα μανιτάρια σε ένα μπλέντερ με λίγα-λίγα από τα ζουμιά τους ώσπου να γίνουν μια παχύρρευστη κρέμα. Αδειάζουμε τη σούπα στην κατσαρόλα, προσθέτουμε το στραγγιστό γιαούρτι και ανακατεύουμε καλά με ένα σύρμα. Για τα κρουτόν φέτας, βάζουμε όλα τα μπαχαρικά σε ένα μπολ και ανακατεύουμε. Κόβουμε τη φέτα σε μικρούς κύβους και τους βουτάμε στο μπολ με τα μπαχαρικά. Στρώνουμε μία λαδόκολλα σε ένα πυρέξ ή ταψάκι και βάζουμε όλα τα κομμάτια της φέτας το ένα μακριά από το άλλο. Ψήνουμε στους 200 C για 15-20’ μέχρι να ροδίσουν. Σερβίρουμε την σούπα ζεστή ή χλιαρή με λίγες σταγόνες ελαιόλαδο, φρεσκοτριμμένο πιπέρι και τα κρουτόν της φέτας ως toping.